轶事:光绪皇帝问他的老师翁同龢:“你买得起鸡蛋吗？”？
据光绪《清惠殿》记载，内务部的主要机构有:楚光司、都督司、张艺司、会计司、庆丰司、刑司、建设司等此外，还有很多附属机构，如三支署、内三旗领事处等。整个机构的规模相当大，几乎像是推动整个清朝国事的六大机关的缩影。曹宗儒在《总经理室考证》中，对总经理室的职责作了如下评论:“...总经办拟为内阁，内务府大臣拟为内阁，总储部拟为户部，都御部拟为军部，张仪部拟为礼部，庆丰部因为是清朝游牧，所以很重要；会计部门计划交粮税，建设部门计划干活，惩罚部门计划惩罚。至于吏部，则属堂医。”
内务部有严格的管理制度。例如，内政部七个部门之一的楚光部是内政部负责收款和出纳的总机构。总储司下设六库，储存金银、珍珠、玉石、珊瑚、玛瑙、宝石的那一库就是银库，是六库之首？康熙十七年(1678)开始，内务府上报皇帝的各种事务的爵位也存放在银库。金库位于明朝嘉靖年间修建的紫禁城太和殿西侧的弘毅阁内，共有员外郎、司库、主事、司库等25人。按照规定，银行的开收有明确的时间和人员限制。如有急用开户行，应逐级上报。图书馆只有得到办公室医生的允许才能开放。开仓库时，必须有两三名仓库官员在场。
闭库时，库务人员应互相签署锁封，然后将锁封贴在锁上。每天晚上都有库管员值班，但是值班的人管不了钥匙。取而代之的是，干青宫的守卫收集并保管六库的钥匙，并在第二天将它们分发给六库。这是清宫著名的门钥匙系统。白银、珠宝等物品的收银员每月要按照老管、新收、辞退、实际入库四项送公司进行核查，然后送内务处进行销售。年底要做一个书名销售黄皮书，法院检查蓝皮书。每五年，皇帝亲自派大臣进行盘点。尽管规章制度如此严格，内务部的腐败却无法杜绝。皇帝再英明，也不可能自己做家务，需要手下处理。办公室里的人拥有这样的权利。每天看着白花花的钱在自己手里流，总会有羡慕，但是办公室赚的钱太多了。
有资料记载，清代朝廷每年用银近四五百万两。清朝末年，雷蒙在《南亭笔记》中记载了一个“鸡蛋问题”，说光绪皇帝喜欢吃鸡蛋，一天吃四个鸡蛋。四个蛋在光绪年间不过十二三个铜钱。御厨房的狮子开口要了整整三十四两银子。光绪有一次和他的老师翁同龢聊天说:“鸡蛋确实好吃，但是这个东西好贵。翁老爷，你买得起吗？”翁同龢知道事情有猫腻。他知道是内务府的人冒领了位，但又不便直接说，只好推脱说:“回皇府或者遇到祭祀仪式，偶尔用用。否则，我不敢。”这样，光绪皇帝光吃鸡蛋就能吃下12412两白银。由此可见，内务府虚报账目，低价买入高价卖给皇帝，主动贪污银两，是多么严重和普遍。政治清朝朝廷一年花四五百万两白银不足为奇。
在清代的笔记中，经常有内务府腐败之弊的记载。何刚德在《春梦》中说，道光很节俭，他还舍不得扔掉自己平时的湖丝裤膝盖上的一个洞，就让内务部补上了。谁知道后来花了三千两银子，比买一条新裤子贵多了。道光问为什么这么贵。内务府回复说，皇帝的裤子是带花的湖丝，找了几百条丝才找到对应的搭配图案。
邓友梅小说《巫娜》中有两句戏言:“方心舒小画不古，此人必是内务府。”据说，如果崭新的大宅里的树是新种的，墙上没有艾草，字画是现代人写的，就可以断定主人是一个新出的内务部官员。
当然，满清内务府的饱食舞弊事件不止一两起，可以写成厚厚的一本书。皇室的成本，因为内务部的太监从中获利，大到没有边际。