自然码汉字输入法的开发过程
1986年，周志农认识了傅，他首先提出了“拼音加”的思想。周志农和何确定了编码方案，并在计算机上实现，命名为金奖智能码。
为了推广金牌智能码，周志农和傅成立了一个实体，隶属于一个发明创造部门。但两者的合作只持续了一年多，因为在输入法的双拼和压缩的关键位置上分歧很大。当时很流行CCDOS的压缩拼音，但是傅坚持自己的双拼压缩方案，拒绝在CCDOS之前学习CCDOS。周志农坚持把金牌智能码的双拼压缩键改成和CCDOS一样。傅说，要改就自己改，周志农就出去开始自己改了。
1988 10，自然码1.0上线，挂靠北京市东城区科协，中国软件公司软件服务中心销售，周志农分红。
1989年中软重组，周志农转到北京电子技术咨询服务中心，独立记账，有一定的管理费。此时，周志农在中关村黄庄某大厦的地下室租下了自己的第一间办公室。周志农在阴暗的地下室待了三四个月，每天按照全国单位全集寄信、发宣传页。
自然代码逐渐出名，开始花1000多元在计算机世界做广告，效果不错。周志农最早的推广方式是举办一个小型展览，用户可以拿着身份证和工作证回去免费试用软件。
周志农用一点收入，雇了七八个兼职，每天出去给大单位的人演示自然代码。如果用户感兴趣，他们将离开试用版，稍后联系他们。这个时候周志农的实体一个月收入4万多，但是不敢积累，因为这个时候挂靠的国有单位开始不景气，越来越难把钱拿出来。
当时周志农想注册一家公司，但是因为社会经验不足，不知道关系。周志农看了《办公司条例》，被要求注册资本要那么多，注册会员要那么多，很多会员要有职称，要有专职会计，吓了一跳。正是从新加坡，周志农下定决心经营一家公司。周志农在新加坡找到了最初的自信。新加坡有个商人愿意出钱开公司，让周志农进去做。周志农不愿意在新加坡把自然码变成产品，然后自己享受一份。这时，周志农遇到了他渴望的伙伴。1991 6月，周志农、何、在民族饭店商谈成立公司事宜。何和当时主要做硬件生意，每个月能卖出几千台1600K打印机。所以公司成立之初的分工是何、负责硬件销售，周志农负责软件。大家合伙组建公司，是为了“互相依靠，有利”。
当时，该公司没有命名为自然代码，因为他赵广和李沛有硬件业务要做。该公司被命名为超翔，因为它想利用联想的知名度。
刚开始因为还没有利益，大家都在为目标奋斗，所以大家合作愉快，“皆大欢喜。”
半年后，超翔公司的打印机销量开始下滑，公司原有的分工计划无法维持。外出独立成立港五奥环公司做收银生意，何开始涉足自然码生意。当时周志农并没有坚决反对何帮忙做自然码，因为当时周志农并不知道自然码这个软件能有多少收入，能有多大前途。“既然大家都愿意一起做，也没什么不好。”
超越的注册是由李沛完成的，他从中关村联合通讯社找到了一份证明并注册了公司。后来官司打到法院，超越在法律上成为中关村美联社的独家投资注册公司，虽然当时美联社没有向超越投资一分钱。
周志农不是超越法定代表人的原因是档案在原单位，一时拿不出来，不方便执业，所以没做。
何的想法是，既然朝香的分工发生了变化，就应该重新分配持股关系。然而，李沛不同意这一事件，并把它拖了下来。但超翔的宣传、销售、产品开发都不能停下来等股份澄清，于是超翔带着问题往前走。
当时周志农并不急着签分成协议，因为他一直牢牢掌握着自然码，所有的产品都是自己在家加密的。磁盘加密后，他拿到了公司的拷贝。周志农天真的以为，如果他不做，或者没有拿到他的提成，公司就没法走下去了。
自然代码和超想CXDOS的业务越做越好，程序越做越大，让周志农实在忙不过来，于是邱劲松和赵泉新加入进来，雷军也来帮忙。
1992年，超翔公司赚了40多万，盈利100多万，周志农得了5万。周志农对这种分配很满意。1993期间，超翔公司高速发展，企业蒸蒸日上。年技术性收入200多万元，利润60万元左右。我想成为国内知名的软件品牌，我有条件也有机会迈上新的台阶。
1994年春，中文DOS平台大战开始，UCDOS、loong、天汇等强劲对手加入竞争，渴望面临转折。此时此刻，周志农希望澄清一下股份和软件著作权的问题。
这个时候，周志农对自然代码和超思维CXDOS有了足够的信心，于是要求更换法人代表，或者开发部门和公司相对独立，像当时的北京金山公司，毛利多少百分比归开发部门。“钱到了开发部，我来分配，不跟公司混。”我很想觉得我做不到这一点。因为周志农拿不到经济权，后来也不让他参与分配。公司开发费用从销售额的10%降到5%再降到3%，并多次抱怨开发费用太高。
周志农从股东的身份降为技术部主任的身份，“他还是技术部主任，没有实权”。
周志农被排除在自然码和汉字系统之外的项目。即使周志农谈了项目，“最后的决定也要由他们来做。”我渴望决定从事财务软件和教学软件。周志农认为不可能成功。“因为财务软件投入很大，所以他们渴望去做。他们坚持做，是因为只做自然代码和思考CXDOS无法消除自我中心的影响。”
这个时候，周志农开始后悔当初很多事情没有谈妥。“一切都是微妙的，慢慢改变的。刚开始并不追求，现在已经逐渐形成了一个公式。如果要改，相当于剥夺了别人的既得利益，肯定会有很大的反弹。”
但周志农还是和几个技术人员商量“反击”，要求公司公开账目，说清楚赚了多少利润，怎么分配的。该公司拒绝透露其账目，称其无利可图。周志农停掉了产品，想让公司开始断货。
这样僵持了一段时间后，周志农想谈个妥协，公司拒绝了，他想办法让周志农的手下交出程序源代码。周志农一气之下不去上班了。有人打电话到超翔公司找周志农，公司说周志农出差了。有了源程序，产品照样能卖，公司没有周志农照样能运转。所以，周志农在1994的电脑展上是那么的激动。
自从想离开，周志农就一直依恋着长城业务促进中心。周志农对软件进行了改进，推广了一个版本的“自然码5.61”、“自然码ForWin”、“自然码中文集成环境”。超翔以“自然码ForWin”和“自然码中文集成环境”属于职务发明为由，起诉长城商务促进中心。同时，周志农还起诉超翔公司，索要超翔公司的股份和财产权，认为自己与超翔之间不是雇佣关系，因此不存在职务发明的问题。
由于开办公司时工商部门保存的原始文件中，朝翔是中关村联社的产权，法院认定周志农等人从联社承包了朝翔，周志农只是承包人之一。既然是承包人，周志农的股份权和产品权就不能得到支持。周志农在随后的诉讼中辩称，既然法院认定超翔公司是承包承包，那么仍然不是雇佣关系。因此，“自然码ForWin”和“自然码中文集成环境”不能简单认定为职务发明。
虽然官司耗时，但“这官司打不起来。如果我不打，我可能会失去自然代码版权的ForWindows部分。”周志农认为，没有《自然密码ForWin》的版权，就失去了基础。
向朱崇军学习
周志农和朱崇军私交不错。周志农与他人合作失败，朱崇俊自始至终独立制作CCED，并取得巨大成功。
不同的道路，不同的结果，周志农认为自己和朱崇军的区别在于，朱崇军有丰富的社会经验，他生长在知识分子家庭，对社会一无所知，也不知道人会有很多想法。“我总觉得我帮你你就帮我，大家在一起就好了。”而“朱崇俊不肯合作，所以他没有走错路。虽然他很慢，但他可以慢慢爬起来，不会摔倒。”
中关村有很多人和周志农同病相怜。王志东、廖恒毅、武晓军等人的经历，让周志农深深感受到“程序员和管理者的合作，靠的是机会。投资人或者合作者选择的好，成功的几率比较高。如果他们选的不好，成功的时候可能会被排挤。”
周志农不想把命运交给别人或者机会。他决定不能再仅仅作为一名技术人员与他人合作。虽然作为技术人员与他人合作时很容易找到合作伙伴，“但那样的话，就会带来反复的问题。”
“我想要的合作是模糊的。不知道自己的价值是什么。这种情况下，别人很难承诺给多少股份。”而“以后找人合作会更谨慎，不只是说说而已，什么都不考虑，什么都不要求。”
以公司名义合作，以公司名义接受投资，没有一定实力是没办法的。所以一开始一定要自己先打好基础，跟包先做，再卖是一样的。
想了这么多，周志农经营合作公司的经验是:
首先，我们应该与他人合作，但我们不应该过分依赖他人。在合作中，要看清自己的实力，自己有什么保留。“在超想，我不是说没有预约。但是公司发展太快，我控制不了。每月的产品产量很大，我一个人在家根本做不完。发展不是我一个人能做的，还得和别人合作。”
第二，合作双方在产品方向上要基本一致。如果分歧大，最好不要一开始就一起做，因为“越做矛盾越多。”
第三，尽早决定分歧容易提前想到的地方，不要等到分歧已经出现才辩论。
第四，技术人员要做一把手。“中关村技术人员的力量普遍太弱，完全被运营商控制，这使得技术的发展是一种扭曲的发展。”