硕士学位论文中的公司名称用字母缩写。

可以,不影响。

字母替代主要是为了避免可能出现的纠纷,未经公司同意必须隐藏真实的公司名称,所以用字母代替。至于论文具体写作过程中用A-Z哪个字母代替公司名称,通常没有严格要求。