SSR锚定引物是什么意思？有没有非锚定引物？

所谓锚定一般是基于第一条引物，所以很容易理解锚定引物是附着在5’端还是3’端。以下内容可以参考锚固底漆的应用。

1.mRNA差异显示反向传递链式反应(DDRT-PCR)是指在不同的生长阶段，在个体发育分化的不同阶段，在生物对疾病的反应中，在不同的环境中，调控基因的表达是不同的，称为基因的差异表达。原理:两组特殊引物用于扩增差异表达基因。3’-末端引物:使用mRNA的聚腺苷酸尾进行设计。根据mRNA结构分析，poly A尾部之前的两个碱基只有12种可能的排列组合:根据这12种排列组合，设计了12条不同的引物，从而将所有的mRNA分为12组。这些引物由11~12 t和另外两个碱基组成，分别用通式5’-t 11MN或5’-t 12MN表示，其中m为A、G、C中的任意一个，n为A、G、C，这种引物称为锚定引物。5’引物:5’末端是由10个碱基组成的随机引物(10聚体)。每个随机引物可以与总mRNA中的一些分子杂交，杂交位点也可以在mRNA的不同位点。用一个3’锚定引物和一个5’随机引物进行扩增，可获得100~500bp的50~100 DNA扩增带。为了找到更多的DNA差异带，应该使用所有12锚定引物和尽可能多的5’随机引物。