如何在NCBI找到目标基因的CDS

找到几个近源物种的基因clustal，找出几个长度大于20的保守区，在这些保守区拉一些引物，放入primer5进行评分，找到一对评分高的引物。产品长度可以是200-1000bp，扩展一下就可以了。如果找不到完全相同的引物，就设计成在不同的碱基上简并。

如果你知道你要找的基因的名称，你可以快速找到你要找的序列，只需要在基因名称检索界面输入就可以了。因为所有提交给NCBI的基因组都可以预测CDS，它们都标明了每个CDS可能的功能以及相应的蛋白质或酶的名称。如果不知道基因名称，可以通过对比来判断，可以尝试使用BIOED。